La misión fundamental del CIMOC es contribuir activamente en el desarrollo académico, científico, tecnológico y productivo del país en todas las áreas relacionadas con el análisis, diseño y comportamiento de los materiales y las obras de infraestructura del país y de la región. Las líneas de investigación del CIMOC están dirigidas fundamentalmente al desarrollo del conocimiento científico en el área de ingeniería estructural, sísmica y materiales, con el fin de generar soluciones a diferentes problemas productivos y sociales de la realidad nacional e internacional.
Convertirse en un centro de excelencia a nivel latinoamericano en investigación básica en el desarrollo y aplicación de nuevos materiales y herramientas de análisis, así como en investigación aplicada y consultoría especializada en temas relacionados con el diseño, comportamiento, rehabilitación y evaluación de las obras civiles y la infraestructura